L’Accademia dei Fisiocritici custodisce campioni di erbario moderni e storici, i più antichi dei quali risalgono al 1780 (erbario Bartalini) e al 1850 (erbario Valenti Serini). La Sala Botanica del seminterrato espone una pressa per la preparazione di campioni essiccati mentre alle pareti, incorniciato a giorno, si può ammirare l’erbario figurato di Biagio Bartalini. Le trenta tavole in carta filigranata furono realizzate ad acquerello nel 1773 e riproducono foglie e altri apparati vegetali.