La collezione generale di minerali comprende 1206 campioni, ordinati sulla base della composizione chimica e dell’aspetto cristallino, provenienti sia dall’estero che dall’Italia. Molto rappresentata è la Toscana meridionale, storicamente uno dei principali distretti minerari italiani. Risaltano per i loro colori campioni di zolfo, malachite, agata e labradorite e per dimensioni un geode di ametista viola del diametro di oltre mezzo metro.