L’Accademia dei Fisiocritici custodisce un ricchissimo patrimonio documentario, costituito da una biblioteca a carattere storico-scientifico, con libri antichi e rari, e un archivio dichiarato "di notevole interesse storico” dalla Sovrintendenza Archivistica per la Toscana. La maggior parte del patrimonio librario è collocato nelle cinque sale della Biblioteca situate al primo piano, tuttavia fondi librari e raccolte di periodici si trovano a ogni piano dell'Accademia. I volumi sono consultabili nell'orario di apertura della Biblioteca.